Το Τμήμα σε συνεργασία με την Εφορεία Αρχαιοτήτων Σερρών διενεργεί ανασκαφική έρευνα στην ακρόπολη της Αμφίπολης, εκεί όπου βρισκόταν το κέντρο της αρχαίας πόλης. Στο πλαίσιο του ερευνητικού αυτού προγράμματος σχεδιάστηκε ο ιστότοπος http://amphipolisproject.org/, ο οποίος παρουσιάζει το πρόγραμμα και ενημερώνει σταδιακά για τις έρευνες, οι οποίες ξεκίνησαν το 2019. Επιπλέον, έχει συγκεντρωθεί η σχετική βιβλιογραφία για την πόλη και τις προγενέστερες ανασκαφές της.

Στην επιστημονική επίβλεψη συνεργάζονται από την πλευρά του Τμήματος ο Δημήτρης Δαμάσκος και από την πλευρά της Εφορείας Αρχαιοτήτων Σερρών η Δημητρία Μαλαμίδου.